OpenMP
R Skript welches das Package multicore verwendet mit OpenMP auf Brutus laufen lassen- R Skript auf Brutus kopieren: scp /u/sfs/R/BrutusEx/openmp_ex.R sgerster@brutus.ethz.ch:.
- auf Brutus einloggen
- R Modul laden: module load r
- 'environment variable' für OpenMP setzen: export OMP_NUM_THREADS=4
- Job in queue aufgeben: bsub -n 4 R CMD BATCH --no-save openmp_ex.R
- Status des Jobs abrufen: bjobs
- Sobald der Job läuft, Output (timings) im .Rout anschauen: less openmp_ex.Rout